Le Conseil scientifique du Japon a proposé qu'une nouvelle matière, « Sciences fondamentales (titre provisoire) », soit instaurée comme matière obligatoire en sciences au lycée et qu'elle soit obligatoire pour le Test du Centre national d'admission à l'université. Cette proposition repose sur le constat d'une crise : l'enseignement scientifique actuel au lycée ne permet pas aux élèves de développer l'attitude empirique nécessaire pour construire une logique fondée sur des faits et prendre des décisions empiriques. Elle suggère qu'au moins six crédits, et idéalement huit, soient consacrés à cette matière.
Cependant, il est difficile d'introduire simultanément de telles matières transversales et complètes. Le rapport préconise donc une introduction progressive, par exemple en rendant obligatoires dans un premier temps les quatre matières suivantes : « Chimie fondamentale », « Physique fondamentale », « Biologie fondamentale » et « Sciences fondamentales de la Terre ». Par ailleurs, il est nécessaire de revoir la formation des enseignants afin de faire progresser l'enseignement dans ces matières, et il est également urgent de mettre en place un système de formation pour le personnel capable d'enseigner de manière exhaustive les sciences fondamentales du secondaire.
Conformément aux directives actuelles du programme, entrées en vigueur en 2012, les étudiants doivent suivre les matières suivantes : « Sciences et Vie Humaine » (2 crédits), « Chimie fondamentale », « Physique fondamentale », « Biologie fondamentale » et « Sciences de la Terre fondamentales » (2 crédits chacune), « Chimie », « Physique », « Biologie » et « Sciences de la Terre » (4 crédits chacune), et « Projets de recherche scientifique » (1 crédit). Les étudiants doivent suivre soit les trois matières fondamentales pour un total de 3 crédits, soit « Sciences et Vie Humaine » et une matière fondamentale pour un total de 6 crédits.
Cependant, l'Organisation de coopération et de développement économiques (OCDE) a déclaré que même si les compétences scientifiques des élèves japonais sont parmi les meilleures au monde à la fin du collège, la culture scientifique et l'intérêt pour la science du grand public sont assez faibles, et a appelé à reconsidérer la manière dont l'enseignement scientifique au lycée est dispensé.
*1 Alphabétisation : La capacité d’extraire et d’utiliser les informations nécessaires à partir de documents donnés.